НМБ активно поддерживает приоритетные направления модернизации библиотечного дела, определенные федеральными программами. Это внедрение новых информационных технологий в формирование электронного каталога и баз данных, при поддержке локальной сети, приобретение более совершенной компьютерной техники, обеспечение безопасности и сохранности библиотечного фонда, участие в межведомственной кооперации российских библиотек.

Отдел автоматизации создан в 1993 году. В 1993-2003 годах была разработана и внедрена в НМБ автоматизированная библиотечно- информационная система "Колибри" (руководитель - А.Н. Филиппов),  ориентированную на стандарт US- и RUSMARC .

С января 2004 года все автоматизированные библиотечные процессы осуществляются в системе автоматизации библиотек "ИРБИС". Ведутся работы по ретроконверсии электронных каталогов, автоматизированной рекаталогизации традиционных каталогов.

 НМБ оснащена 17 персональными компьютерами различных поколений, объединенных в локальную сеть. В настоящее время проводится постепенная замена устаревшей компьютерной техники на более современную.

Для улучшения внешнего информационного обслуживания НМБ поддерживает  долгосрочные программы по кооперации в области информационных услуг. В 1999 г. НМБ участвовала в проекте «Корпоративная каталогизация вузов Петербурга», поддержанного Институтом Открытое Общество (Фонд Сороса) .

В 1998г. была создана страница НМБ в сети Интернет.

Новые технологии НМБ активно использует в решении проблем сохранности фондов. Создана долгосрочная программа по созданию электронного страхового фонда особо ценных документов с применением вычислительной техники (сканирование, цифровая фотосъемка, электронный каталог изображений, научный аппарат системы воспроизведение, перевод на CD-ROM).